M1100-CMS23
Applied Bioinformatics
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| Modulverantwortlich: |
Prof. Dr.-Ing. Michael Schroeder |
| Anzeige im Stundenplan: |
CMS-CLS-ABI |
| Dauer: |
1 |
| Anzahl Wahlkurse: |
0 |
| Credits: |
5,0
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| Startsemester: |
SoSe 2019 |
| Verantwortliche:r Dozent:in |
Prof. Dr. Michael Schroeder
michael.schroeder@tu-dresden.de |
| Qualifikationsziele |
Die Studierenden beherrschen nach Abschluss des Moduls die methodischen Grundlagen der Sequenzanalyse und weiterer bioinformatischer Algorithmen. Sie kennen wesentliche Algorithmen und können diese einordnen, analysieren und bzgl. ihrer Zielstellung und Effizienz beurteilen. |
| Inhalte |
Inhalt des Moduls sind die Grundlagen des Sequenzvergleiches. Hierzu zählen Algorithmen wie z. B. Levenshtein Distanz, dynamisches Programmieren, globales und lokales Alignment, Substitutionsmatrizen, multiples Sequenzalignment und andere. |
| Lehr- und Lernformen |
Das Modul umfasst 2 SWS Vorlesung und 2 SWS Übung sowie das Selbststudium. |
| Voraussetzungen für die Teilnahme |
Es werden Grundkenntnisse in Computerprogrammierung, Grundlagen der Zell- und Molekularbiologie sowie Wahrscheinlichkeitsrechnung und Statistik auf Bachelor-Niveau vorausgesetzt.
Mit der folgenden Literatur können sich die Studierenden auf das Modul vorbereiten:
Schildt: C++ from the ground up, McGraw-Hill, 2003
Abelson, Hal; Sussman, Gerald Jay: Structure and Interpretation of Computer Programs. MIT Press, 1985;
Alberts, Bray, Hopkin, Johnson, Roberts, Lewis: Essenial Cell Biology, Taylor & Francis, 2013
Jaynes: Probability Theory: The Logic of Science, Cambridge Universi-ty Press, 2003. |
| Verwendbarkeit |
Das Modul ist im Masterstudiengang Computational Modeling and Simulation ein Pflichtmodul für Studierende des Tracks Computational Life Science. |
| Voraussetzungen für Vergabe von Leistungspunkten |
Die Leistungspunkte werden erworben, wenn die Modulprüfung bestanden ist. Die Modulprüfung besteht aus einem Test im Umfang von 45 Minuten. |
| Leistungspunkte und Noten |
Durch das Modul können 5 Leistungspunkte erworben werden. Die Modulnote entspricht der Note der Prüfungsleistung. |
| Häufigkeit des Moduls |
Das Modul wird jedes Sommersemester angeboten. |
| Arbeitsaufwand |
Der Arbeitsaufwand beträgt insgesamt 150 Stunden. |
| Dauer des Moduls |
1 Semester |
| Modulnummer Modulhandbuch TU Dresden |
CMS-CLS-ABI |
